Oportunidades de Dissertação
Nesta secção do website da ANEEB apresentamos-te diferentes Oportunidades de Tese disponibilizadas pelas empresas e instituições abaixo listadas. Muitas destas entidades não têm ainda os temas das dissertações definidos, sendo que estes poderão ser posteriormente discutidos mediante os projetos que estiverem a decorrer durante o teu período de dissertação, mediante o que for do teu interesse, e mediante o que for permitido pela tua instituição de ensino. Para saberes mais informações sobre as oportunidades que te apresentamos, deverás entrar em contacto com as entidades através dos respetivos endereços de email.
4ALL Software
Instituição: 4ALL Software
Nome do Responsável: Benjamin Fonseca
Contacto: benjamim.fonseca@4all-software.com
Tema da Dissertação: Área da Informática
Descrição da Dissertação: Área da Informática
Período: 9 meses
Association Patient Innovation
Instituição: Association Patient Innovation
Nome do Responsável: Maria João Jacinto
Contacto: maria.joao.jacinto@patient-innovation.com
Áreas de atuação: Flexibilidade dentro do tema de inovação pelo utilizador nos cuidados de saúde
Descrição da Dissertação: Flexibilidade dentro do tema de inovação pelo utilizador nos cuidados de saúde.
Período: aberto a negociação
ByMe Information Technology & Health Care
Instituição: ByMe Information Technology & Health Care
Nome do Responsável: Ernesto Palhares
Contacto: ernesto.palhares@byme.pt
Área de atuação: Informática Médica
Tema da Dissertação: Temos flexibilidade no que ao tema de Dissertação diz respeito desde que se enquadre na área de atuação da empresa.
Descrição da Dissertação: Temos flexibilidade no que ao tema de Dissertação diz respeito desde que se enquadre na área de atuação da empresa.
Período: Existe flexibilidade
ICVS - Escola de Medicina, Universidade do Minho
Instituição: ICVS – Escola de Medicina, Universidade do Minho
Nome do Responsável: João Filipe Oliveira
Área de atuação: Neurociência e Biologia Molecular
Tema da Dissertação: Following the stars to understand neuron-astrocyte interactions in brain function to treat depression
Descrição da Dissertação: The dissertation topic and structure will be discussed with the student. Recording and decoding neuronal activity to assess the role of star-shaped astrocytes in the control function of cortico-hippocampal circuits involved in the pathophysiology of depression. By assessing its neural signatures during learning and memory tasks, we expect to dissect the net role of astrocytes in these functions. These results will ultimately provide insights into the roles of astrocytes in the human brain in health and in the context of depression. This project aims to elucidate the role of astrocytes in the function of cortico-hippocampal circuits underlying depression, employing neuronal recordings in vivo. The work plan may include (to be discussed with the student) all the experimentation from (1) manipulation and testing of animal models and electrophysiological techniques to record spikes and local field potentials in anesthetized or freely behaving animals; (2) analysis and interpretation of results linked to the behavioral performance of mice. This way, the student will benefit from a flexible experimental approach, including electrode construction, surgery, electrophysiological recording, behavioral analysis, and signal analysis and interpretation. Our laboratory has all the equipment, technical requirements, and reagents available for the project. This project is part of our recently funded laCaixa Foundation Grant to study the physiology of cortico-limbic circuits involved in cognition and depression. The overall budget is 0.5 million euros and includes support to carry out these MSc dissertations and fellowships to pursue a PhD. More information under: https://fundacionlacaixa.org/en/caixaresearch-health-call-2021-project-depression-therapies
Período: To discuss with the student
ICVS - Escola de Medicina, Universidade do Minho
Instituição: ICVS – Escola de Medicina, Universidade do Minho
Nome do Responsável: Ricardo Silvestre e Marta Araújo
Contactos: ricardosilvestre@med.uminho.pt e id10767@alunos.uminho.pt
Área de atuação: Informática Médica
Tema da Dissertação: Dinâmica do Tecido Adiposo na Imunopatogénese da Leishmaniose Visceral
Descrição da Dissertação: A leishmaniose visceral (LV) é uma doença negligenciada causada pelo protozoário Leishmania, prevalente em regiões tropicais e subtropicais, afetando milhões de pessoas em todo o mundo. Investigações recentes indicam que a obesidade é um fator de risco significativo para a infeção, impactando a progressão da doença e a resposta ao tratamento. O tecido adiposo desempenha um papel crucial nas respostas imunológicas, desafiando o seu papel convencional como apenas um reservatório de energia. Propõe-se que os parasitas Leishmania colonizem o tecido adiposo, que pode servir como um reservatório eficaz contra terapias anti-Leishmania. Os adipócitos, como principais locais de armazenamento de lípidos, oferecem um ambiente favorável para a persistência do parasita. A Leishmania manipula o metabolismo energético e as estruturas subcelulares dos macrófagos hospedeiros, influenciando as suas funções efetoras. Essas adaptações atendem às necessidades energéticas do parasita e afetam a diferenciação celular e as respostas imunológicas, que são cruciais para a sobrevivência ou eliminação do parasita. A identificação desses mecanismos pode revelar novos alvos terapêuticos para combater a LV, especialmente em populações obesas onde o impacto da doença é significativo.
Período: Setembro-Maio (9 meses)
ICVS - Escola de Medicina, Universidade do Minho
Instituição: ICVS – Escola de Medicina, Universidade do Minho
Nome do Responsável: Cláudia Nobrega
Contacto: claudianobrega@med.uminho.pt
Área de atuação: Neuroimunologia
Tema da Dissertação: Inflammation at the nervous system interfaces
Descrição da Dissertação: Multiple sclerosis (MS) is a highly debilitating autoimmune disease of the central nervous system that affects more than 2.3 million people worldwide, and over 5000 in Portugal. This autoimmune disease is mediated to a great extent by autoreactive T cells. The initial course of MS follows one of two paths: the relapse-remitting (RRMS) and the primary progressive (PPMS), the former representing 85-90% of total MS cases. The natural progression of MS increases treatment-related costs and impacts highly on patient’s wellbeing which highlights the urgency to find a cure or treatment to halt disease progression (1). Autologous hematopoietic stem cell transplantation (aHSCT), devoted to the most severe forms of disease, leads to a relevant delay of disease progression and, in 3 out of 10 patients, to suppression of disease manifestation assessed 10 years following aHSCT (2). These trials’ success suggests that newly differentiated T cells, generated by the patient thymus, do not directly drive MS. Two main exciting hypotheses need to be tested: are the circumstances that lead to the differentiation and activation of autoreactive T cells transitory (ie. happening before disease onset), and/or rely on a slow and progressive process that takes several years to manifest. Addressing these hypotheses is the main goal of this proposal. To tackle these issues, the project is based on a cohort of newly-diagnosed RRMS and PPMS patients, and healthy controls (HC). Studying MS patients in such an initial phase of the disease manifestation is essential to identify immunological alterations, specifically at the T cells’ level, closer to the initial events that drive MS. In contrast to the reported prematurely aged immune system in MS patients (e.g. (3)) our results show that newly-diagnosed RRMS patients have lower overall percentages and numbers of memory CD4+ and CD8+ T cells, suggestive of general T cells alterations at disease onset (Annex1). To identify these modifications, we will first undertake an exploratory approach by evaluating the transcriptional profile of T cell subsets, at the single cell level. We will first focus on the most immature RTE, to the naïve and memory T cells, though we expect other T cell subsets to arise based on the transcriptome analysis. As blood T cells’ phenotype tips towards a less activated phenotype in newly-diagnosed MS patients, we will perform functional assays that will allow us to understand if, in these patients,: i) naïve T cells have impaired homeostatic proliferation [upon stimulation of CD31+ naïve T cells (RTE) with IL7]; ii) the T cell receptor activation threshold is altered thus impairing differentiation of naïve T cells into the memory phenotype; iii) memory T cells are less proliferative and/or more prone to die upon stimulation with specific (myelin peptides) or unspecific stimuli; iv) overall memory T cells are more prone to migrate to tissues. All these analyses will be performed in newly-diagnosed RRMS patients, and HC.
Período: a discutir com o candidato
i3S Instituto de investigação e Inovação em Saúde
Instituição:i3S Instituto de investigação e Inovação em Saúde
Nome do Responsável: João Morais Cabral
Contacto: jcabral@ibmc.up.pt
Área de atuação: Biofísica/Bioquímica
Tema da Dissertação: Biofísica/Bioquímica
Descrição da Dissertação: Sensores de fluorescência; simulação computacional de redes de sinalização biológicas
Período: Ano letivo
i3S Instituto de investigação e Inovação em Saude
Instituição: i3S Instituto de investigação e Inovação em Saúde
Nome do Responsável: Sónia Melo
Contacto: smelo@i3s.up.pt
Área de atuação:
Tema da Dissertação: Uncover novel therapeutic strategies for pancreatic cancer
Descrição da Dissertação: Study the communication axis between pancreatic tumors and the thymus to determine the role of the tumor in the establishment of immune tolerance at a distance.
Período: Julho/Agosto 2024 – Junho/Setembro 2025
Bioprosthetics Inc
Institution: Bioprosthetics Inc
Address: 550 South College Ave, Suite 110, Newark DE 19713 USA
Email: info@bioprostheticscorp.com
Contact: Dr. Arun Kumar
Areas Of Expertise: Biomedical Engineering , Cell and Tissue Engineering
Brief Company´s Description: Bioprosthetics Inc, a biomedical research company dedicated to the development of 3D-printed bone grafts, skin grafts, and eye lenses. Our team consists of scientists, surgeons, biomedical engineers, and professors, all deeply committed to improving the quality of human life.
Brief Description of the project and the candidate role: The project will be on Bioprosthetics design and 3D Bioprinting of tissues and Bone graft
Period: During the training period
Additional Comments: If students will perform well it is possible to give students a project to further continue with company to possible pay stipend.
Laboratório de Biomecânica e Morfologia Funcional
Institution: Laboratory of Biomechanics and Functional Morphology
Name of Person Responsible: Sílvia Cabral
Contact: labneuromechanics@fmh.ulisboa.pt
Area of expertise: Rehabilitation and Biomechanics
Dissertation Topic: Possibilities:
1. Changes in movement resulting from aging
2. Assessment of mechanical load on the musculoskeletal system in children with Cerebral Palsy
3. Occupational Biomechanics (mechanical factors related to work-related injuries)
4. Biomechanical factors associated with sports injuries (particularly anterior cruciate ligament injury and hamstring tears)
5. Biomechanical factors associated with sports performance (particularly using different vertical jumps as tests)
Dissertation Description: Within the various themes, depending on the course of the projects in the laboratory and the student’s motivations, the work may involve:
– Validation of motion analysis technology (themes 1, 3 and 5)
– Rigid body modeling (all topics)
– Musculoskeletal modeling (theme 2 and 4)
– Collection of movement data (all themes) – Development of command lines (the software will depend on the theme) and reports with movement data (all themes)
Period: 1 academic year
CNC-UC | Centro de Neurociências e Biologia Celular
Instituição: CNC-UC | Centro de Neurociências e Biologia Celular
Nome do Responsável: Ana Rita Álvaro
Contacto: ritaa80@cnc.uc.pt
Área de atuação: Bioinformática
Tema da Dissertação: Avaliação do impacto das doenças do sono e doenças associadas com a idade em mecanismos de regulação dos ritmos biológicos
Descrição da Dissertação:
i) Explorar o impacto da SAOS e da insónia nos relógios biológicos;
ii) Criar um sistema de biomarcadores dos dois distúrbios do sono mais prevalentes (SAOS e insónia), com aplicação clínica;
iii) Avaliar o impacto da SAOS e da insónia nas características celulares e moleculares do envelhecimento;
iv) Realçar a importância do diagnóstico precoce para evitar o desenvolvimento de comorbidades;
v) Reforçar a importância de aumentar a sensibilização sobre um sono saudável para atrasar o envelhecimento e as doenças associadas à idade.
Período: Todo o ano
NOTA: Dissertação a iniciar, idealmente, a partir de Setembro de 2024
BestHealth4u
Instituição: BestHealth4u
Nome do Responsável: Nelson Oliveira
Contacto: 937152575
Áreas de atuação: a analisar na altura, mas será nas áreas de biomateriais e machine learning
Descrição da Dissertação: a analisar com o alun@
Período: o ano letivo, mas analisaremos com maior detalhe na altura
Comentário Adicional: Estamos disponíveis para um estágio emprego em meio empresarial (IEFP) e teses de doutoramento em meio empresarial
HWMed
Instituição: HWMed
Nome do Responsável: Pedro Moreira
Contacto: pedro.moreira@hwmed.pt
Tema da dissertação: Tema relacionado a área de Engenharia Clínica
Descrição da dissertação: gestão de tecnologias médicas, ferramentas de qualidade na gestão e melhoria da manutenção, Avaliação de tecnologias em saúde, Custo total de oportunidade (TCO), avaliação de investimento na área da Saúde, etc.
Período: A definir
iLoF
Instituição: iLoF
Nome do Responsável: Bruno Silva
Contacto: bsilva@ilof.tech
Áreas de atuação: Flexible – Personalized medicine
Descrição da Dissertação: Flexible – to be adapted together with candidate and faculty
Período: Any time – ongoing program
ICVS - Escola de Medicina, Universidade do Minho
Instituição: ISR | Instituto de Sistemas e Robótica
Nome do Responsável: Helder Araújo
Contactos: helder@isr.uc.pt / 239 796 216
Área de atuação: Visão por Computador
Tema da Dissertação: Análise de imagens de cápsulas endoscópicas multi-câmara
Descrição da Dissertação:
1-Melhoria da imagem,
2-Super-resolução,
3-Detecção de lesões em múltiplas imagens do mesmo tracto
Período: 2º Semestre de 23/24 ou 1º Semestre de 24/25
Instituto Politécnico de Viana do Castelo - proMetheus - Research Unit on Materials, Energy and Environment for Sustainability
Instituição: Instituto Politécnico de Viana do Castelo – proMetheus – Research Unit on Materials, Energy and Environment for Sustainability
Nome do Responsável: Luís Rocha
Contactos: laugustorocha@estg.ipvc.pt/ 962931420
Área de atuação: Biomateriais
Tema da Dissertação: It can be developed within the following fields:
– Surface biofunctionalization of titanium-based materials for orthopaedic implants (balance between osteogenic, antibacterial, corrosion and wear resistance);
– 3D printing of Ti-based composites reinforced with ceramic particles;
– Investigation of fatigue-corrosion mechanisms of 3D printed Ti-based composites.
Descrição da Dissertação: Part of the dissertation can be carried out in other National or International Institutions. All topics can involve biological tests (involving bone cells and/or microorganisms)
Período: Setembro 2024 – Junho 2025
INL | International Iberian Nanotechnology Laboratory
Instituição: INL | International Iberian Nanotechnology Laboratory
Nome do Responsável: Ana Ribeiro
Contactos: ana.ribeiro@inl.int / 913 914 535 / 253 140 112
Área de atuação: Engenharia de Células e Tecidos
Tema da Dissertação: Desenvolvimento de um sistema de microbioma da pele em chip para testes de cosméticos.
Descrição da Dissertação: Desenvolvimento de um sistema de pele em chip integrado com sensores para avaliação da toxicidade de cosméticos.
Período: 1 ano
LABIOMEP | Laboratório de Biomecânica do Porto
Instituição: LABIOMEP | Laboratório de Biomecânica do Porto
Nome do Responsável: Maria João Jacinto
Contacto: info@labiomep.up.pt
Áreas de atuação: Biomecânica
Descrição da Dissertação: A eventual recepção de estudantes deverá decorrer por solicitação do estudantes e de um orientador da respetiva orientação. O LABIOMEP poderá acolher o estudante para a realização dos trabalhos experimentais numa modalidade de colaboração inter-institucional e com objetivos definidos por ambas as partes.
Período: aberto a negociação
Laboratório de Função Neuromuscular
Instituição: Laboratório de Função Neuromuscular
Nome do Responsável:
Contacto: jpaulo@isr.uc.pt
Área de atuação: Machine Learning (Bioinformática)
Tema da Dissertação: Brain-computer interfaces; Machine learning applied to autism
Descrição da Dissertação: The candidate will have the opportunity to integrate different projects in the context of brain-computer interfaces as well as the study of autism spectrum disorder through machine learning appled to EEG and 3D motion.
Período: Qualquer
Laboratório de Função Neuromuscular
Instituição: Laboratório de Função Neuromuscular
Nome do Responsável: Gonçalo Mendonça
Contactos: gmendonca@fmh.ulisboa.pt; andrediasgonca@gmail.com
Área de atuação: Fisiologia do Exercício
Tema da Dissertação: The influence of nociception on exercise induced fatigue: the analgesic role of acute exercise and long-term training of different exercise modalities
Descrição da Dissertação: O projeto de investigação compreende dois estudos onde se pretende comparar o efeito analgésico local e sistémico do exercício agudo (estudo 1) e treino crónico de 6 semanas (estudo 2) de três estímulos diferentes (exercício aeróbio, anaeróbio e de força muscular) relacionando-o com a dessensibilização do metaboreflexo (aferências nervosas do tipo III e IV). Como métodos de avaliação, serão utilizados o teste de tolerância a um estímulo térmico (frio), limiar de dor a estímulo de pressão (algómetro), dinamometria isocinética com eletroestimulação nervosa percutânea, equipamento de restrição vascular, prova de esforço cardiorrespiratória com análise de gases e teste de Wingate
Período: 2024/2025
Laboratório de Função Neuromuscular
Instituição: Laboratório de Função Neuromuscular
Nome do Responsável: Sandro Freitas
Contacto: sfreitas@fmh.ulisboa.pt
Área de atuação: Fisiologia do Exercício
Tema da Dissertação: Desenvolvimento de providência de análise avançada de sinais biológicos de futebolistas
Descrição da Dissertação: Saúde, Performance e Bem Estar
Período: 24/25 e anos seguintes
Lysosomes & Disease Lab
Instituição: Lysosomes & Disease Lab
Nome do Responsável: Otilia Vieira
Contactos: otilia.vieira@nms.unl.pt | 969 027 559
Área de atuação: Biologia Celular e Molecular
Tema da Dissertação: O tema é flexível, no entanto que tem de se enquadrar dentro dos interesses do laboratório, nomeadamente no estudo da aterosclerose.
Descrição da Dissertação: O plano de trabalhos é escrito em conjunto com o estudante e tendo em conta os seus interesses, os interesses do laboratório e os recursos disponíveis. Os modelos de linhas celulares permitem o estudo da doença de forma reprodutível e fiável, no entanto têm as suas limitações e por isso também podemos recorrer a modelos animais ou a outro tipo de modelos como por exemplo os organoides.
Período: 1 ano para mestrados ou 4 anos para doutoramentos
Lean Health Portugal
Instituição: Lean Health Portugal
Nome do Responsável: Rui Cortes
Contacto: 937887131
Áreas de atuação: Digital Twins, Modelos Preditivos em Saúde e Ferramentas de Apoio à Decisão
Período: Dependente do calendário da Instituição
LIBPHYS - Biosignals Group
Instituição: LIBPHYS – Biosignals Group
Nome do Responsável: Hugo Gamboa
Contacto: hgamboa@fct.unl.pt / 962 611 197
Área de atuação: Reabilitação e Biomecânica Tema da Dissertação: Engenharia Biomédica – Eletrofisiologia
Descrição da Dissertação: Estudo preliminar da condução nervosa usando eletroestimulação e eletromiografia de alta resolução temporal no membro inferior. O candidato apoiará na recolha e processamento dos biossinais.
Período: A decidir após contacto inicial
Nova Medical School
Instituição: Nova Medical School
Nome do Responsável: Miguel Seabra
Contactos: miguel.seabra@nms.unl.pt | 969 027 559
Área de atuação: Biologia Celular e Molecular
Tema da Dissertação: Novas terapias para doenças na retina
Descrição da Dissertação: Temos vários temas de interesse para tese de dissertação, incluindo “anti-ageing drugs in AMD”, “Nrf2 activators in AMD”, “Melanin as a protective factor in AMD”, “Mechanisms of cell death in Choroideremia”
Período: A partir de fevereiro 2024
Lean Health Portugal
Instituição: Nova Medical School
Nome do Responsável: Cláudia Almeida
Contacto: claudia.almeida@nms.unl.pt / 969 941 245
Área de atuação: Machine Intelligence Tema da Dissertação: Machine intelligence applied to phenotypic profiling of Alzheimer disease subtypes
Descrição da Dissertação: Existe flexibilidade. Diferentes possibilidades incluem “The candidate will initiate a novel project in the lab focused on using machine intelligence applied to phenotypic profiling of Alzheimer disease subtypes. The work will involve creating a repository of microscopy images, fine-tuning image analysis pipelines using machine learning or deep learning.”
Período: A decidir após contacto inicial
Nova Medical School
Instituição: Nova Medical School
Nome do Responsável: João Ferreira
Contactos: joao.ferreira@nms.unl.pt | 218 803 101
Área de atuação: Biologia Celular e Molecular
Tema da Dissertação: The study of extracellular vesicles in inter-tissue and inter-organ communication Descrição da Dissertação: Extracellular vesicles, represent the emerging regulators of organismal function, akin to what hormones have been traditionally recognized for. In light of this, my research endeavors in the forthcoming years will be intrinsically linked to the study of EVs in inter-tissue and inter-organ communication.
Período: 1 ano (setembro a setembro)
IPDJ- CARJamor
Instituição: IPDJ- CARJamor
Nome do Responsável: A designar pelo CarJamor Contacto: carjamor@ipdj.pt
Tema da dissertação e área de atuação: Áreas relacionadas com a otimização do rendimento desportivo e a prevenção e recuperação de lesões.
Descrição da Dissertação: Abertura às propostas dos estudantes, desde que contribuam para melhoria da preparação dos atletas.
Período: A combinar com o estudante.
Padrão Ortopédico
Instituição: Padrão Ortopédico
Nome do Responsável: Carolina Coraini
Contacto: 919294029
Tema e descrição da dissertação: Novos produtos/processos na área da ortoprotesia.
Período: Este tempo é atribuído tendo em conta os critérios de cada Universidade
Safe AI [4U]
Instituição: Safe AI [4U]
Nome do Responsável: David Belo
Contacto: david.belo@safe-ai-4u.eu
Áreas de atuação: AI aplicado a biosinais, Utilização de dados sintéticos, AI em medicina, AI responsável
Descrição da Dissertação: Análise e processamento de biosinais (ex:ECG) com AI, incorporação de dados sintéticos nessa análise como forma de melhorar a performance, outras aplicações de AI em medicina, ética e responsabilidade em AI
Período: De 01/09/2024 em diante
Universidade do Minho | Centro de Engenharia Biológica
Instituição: Universidade do Minho | Centro de Engenharia Biológica
Nome do Responsável: Joana Rodrigues
Contacto: joanarodrigues@deb.uminho.pt
Áreas de atuação: Bioengenharia
Tema da Dissertação: Biosynthesis optimization of the therapeutic compound curcumin using engineered Saccharomyces cerevisiae and evaluation of its antimicrobial activity
Descrição da Dissertação: Curcumin is a polyphenolic compound extracted from the plant Curcuma longa applied as food additive and in traditional medicine due to its several therapeutic properties, including antioxidant, anti-inflammatory, anticancer activity, anti-Alzheimer, antimicrobial, among others. Curcumin is obtained from C. longa with low yields as a mixture with other curcuminoids with different therapeutic activities. Pure curcumin is very expensive, but important to determine its therapeutic activity without interferences. Given its high therapeutic potential, biosynthetic pathways for its production were constructed in our research group (10.1002/biot.202100400; 10.1128/MMBR.00031-14; 10.1016/j.enzmictec.2015.01.001; 10.3389/fbioe.2020.00059; 10.1016/j.bej.2017.05.015). Recently, Saccharomyces cerevisiae strain was successfully engineered to produce curcumin from glucose and industrial by-products although with low titers (unpublished). Currently, the engineered strain and pathway need to be optimized regarding extender substrate (malonyl-CoA) and methyl donor substrate (S-adenosyl methionine) availability. The optimization of the engineered strain may involve strategies such as increasing or supressing the expression of key enzymes using state-of-the-art technologies such as CRISPR-Cas9. In addition, other endogenous modifications may be performed based on in silico results obtained by bioinformatic analysis. Finally, the fermentation conditions need to be optimized to facilitate curcumin production and the antimicrobial activity of pure biosynthetic compound needs to be evaluated. The objective of this study is to enhance curcumin production in S. cerevisiae using CRISPR-Cas9 to improve the host. The specific goals of the research project are as follows: – Optimization of fluxes in order to increase the availability of malonyl-CoA and SAM, which are key extender and methyl donor substrates, respectively. This can be achieved by deleting or overexpressing native yeast genes or by introducing heterologous genes with better performance; – Implementation of genetic modifications based on previous obtained bioinformatic analysis results to further improve the production of curcumin; – Optimization of fermentation conditions; – Evaluation of biosynthetic curcumin antimicrobial activity against several pathogenic bacteria.
Universidade do Minho | Centro de Engenharia Biológica
Instituição: Universidade do Minho | Centro de Engenharia Biológica
Nome do Responsável: Clarisse Nobre
Contacto: clarissenobre@ceb.uminho.pt
Áreas de atuação: Biotecnologia e Bioengenharia da saúde
Tema da Dissertação: The role of prebiotics in microbiota-brain damage in obesity
Descrição da Dissertação: Current non-invasive treatments lack efficacy in combating the worldwide emergent epidemic of obesity. Obesity is related to unbalanced gut microbiota which directly affects the brain. Prebiotics consumption, which are non-caloric sugars, may act as an alternative treatment to obesity. In this project, a clinical trial will be developed at the Hospital of Braga to collect data on microbiota (gut bacteria identification – 16S metagenomics), and brain functioning (brain imaging) before and after treatment with prebiotics. In the lab, in-vitro trials will simulate the reversion of microbiota in bioreactors simulating the human colon. The project will be developed at the Hospital of Braga and CEB, in collaboration with the CiPsi-Psychology Research Centre. The aim of this study is to determine the possibility of reversing obesity by improving the composition/functioning of the gut microbiota with prebiotics, and study the interplay between obesity, gut microbiota, and brain functioning, a totally unexplored research field with major clinical applications. Objective 1) Implement a randomized clinical trial – Individuals with obesity will be recruited. For 3 months participants will consume daily a prebiotic/placebo. It will be analyzed i) their microbiota profile, and ii) their neurofunctional activity (rs-fMRI) before and after intervention. Objective 2) Study in-vitro the evolution of the microbiota composition – Stool samples collected in the clinical trial will be tested. Stool fermentation with/without prebiotic supplementation will be tested. Analysis: gut bacterial population changes (qPCR) and microbiota metabolites released during the fermentation: SCFA, ammonia, LPS, and hormones related to appetite control – Serotonin, GABA (HPLC and selected kits).
Período: 12 meses, a começar até setembro de 2024
Universidade do Minho | Centro de Engenharia Biológica
Instituição: Universidade do Minho | Centro de Engenharia Biológica
Nome do Responsável: Ângela França
Contacto: afranca@ceb.uminho.pt
Áreas de atuação: Biotecnologia e Bioengenharia da saúde
Tema da Dissertação: Estudo dos mecanismos de resistência a antibióticos em estafilococos coagulase-negativos
Descrição da Dissertação: As bactérias do grupo estafilococos coagulase negativas (do inglês coagulase-negative staphylococci, CoNS) são uma causa frequente de infeções associadas ao uso de dispositivos médicos, devido à sua capacidade de colonizarem estes dispositivos e formarem biofilmes. Os biofilmes protegem as bactérias da resposta do sistema imunitário e da ação dos antibióticos. Por isso, as infeções causadas por biofilmes de CoNS, as quais afetam maioritariamente pacientes imunocomprometidos e bebés prematuros, são cada vez mais difíceis de tratar, resultando num aumento das taxas de morbilidade e mortalidade. É, por isso, importante caracterizar a resposta desta bactéria durante a infeção para tentar desenvolver estratégias de prevenção e/ou tratamento mais direcionadas e mais eficientes. Neste tema o candidato teria como funções realizar experiências básicas de microbiologia (crescimento bacteriano, formação de biofilmes, técnicas de quantificação de biofilmes) e de biologia molecular (extração de RNA, PCR, PCR quantitativo). Para além das competências práticas, o candidato teria de realizar pesquisa bibliográfica para delinear as experiências descritas e compreender a temática em estudo, bem como integrar os resultados obtidos com a literatura atual.
Período: setembro 2024 – setembro 2025
Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra
Instituição: Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra
Nome do Responsável:
Contacto: mafalda.c.martins@gmail.com
Área de atuação: Flexibilidade
Tema da Dissertação:
Descrição da Dissertação:
Período:
Universidade do Minho | Centro de Engenharia Biológica
Instituição: Universidade do Minho | Centro de Engenharia Biológica
Nome do Responsável: Clarisse Nobre
Contacto: clarissenobre@ceb.uminho.pt
Áreas de atuação: Biotecnologia e Bioengenharia da saúde
Tema da Dissertação: The role of prebiotics in microbiota-brain damage in obesity
Descrição da Dissertação: Current non-invasive treatments lack efficacy in combating the worldwide emergent epidemic of obesity. Obesity is related to unbalanced gut microbiota which directly affects the brain. Prebiotics consumption, which are non-caloric sugars, may act as an alternative treatment to obesity. In this project, a clinical trial will be developed at the Hospital of Braga to collect data on microbiota (gut bacteria identification – 16S metagenomics), and brain functioning (brain imaging) before and after treatment with prebiotics. In the lab, in-vitro trials will simulate the reversion of microbiota in bioreactors simulating the human colon. The project will be developed at the Hospital of Braga and CEB, in collaboration with the CiPsi-Psychology Research Centre. The aim of this study is to determine the possibility of reversing obesity by improving the composition/functioning of the gut microbiota with prebiotics, and study the interplay between obesity, gut microbiota, and brain functioning, a totally unexplored research field with major clinical applications. Objective 1) Implement a randomized clinical trial – Individuals with obesity will be recruited. For 3 months participants will consume daily a prebiotic/placebo. It will be analyzed i) their microbiota profile, and ii) their neurofunctional activity (rs-fMRI) before and after intervention. Objective 2) Study in-vitro the evolution of the microbiota composition – Stool samples collected in the clinical trial will be tested. Stool fermentation with/without prebiotic supplementation will be tested. Analysis: gut bacterial population changes (qPCR) and microbiota metabolites released during the fermentation: SCFA, ammonia, LPS, and hormones related to appetite control – Serotonin, GABA (HPLC and selected kits).